Nếu như chi nhánh của doanh nghiệp là đơn vị phụ thuộc của doanh nghiệp nhưng có thể thực hiện được toàn bộ chức năng hoặc một phần chức năng của doanh nghiệp trong đó đặc biệt được thực hiện được chức năng đại diện theo ủy quyền thì văn phòng đại diện của doanh nghiệp chỉ là đơn vị phụ thuộc của doanh nghiệp cớ chức năng đại diện theo ủy quyền cho lợi ích doanh nghiệp và thực hiện chức năng giao dịch với khách hàng mà không được trực tiếp phát sinh hoạt động kinh doanh của doanh nghiệp. Tuy nhiên, văn phòng đại diện vẫn có đăng ký giấy chứng nhận hoạt động riêng và con dấu riêng để phục vụ các hoạt động trong nội bộ của văn phòng đại diện. Cũng như chi nhánh doanh nghiệp chỉ được thành lập văn phòng đại diện sau khi hoàn tất thủ tục thành lập doanh nghiệp. Mã số hoạt động của văn phòng đại diện là mã số trực thuộc của doanh nghiệp. Khác với chi nhánh do văn phòng đại diện không phát sinh hoạt động kinh doanh nên cũng không phát sinh nghĩa vụ thuế độc lập.